Mevsim sonbahara döner. Kahramanın mücadelesi ve grubu S.E.E.S. ‘Gölgeler’ adlı garip canavarlarla sona yaklaşılıyor. Makoto ve müttefikleri, Karanlık Saat’i sona erdirmek için Gölgeler ile ölüm kalım savaşlarına girer. Savaşlar yoluyla, bazıları arkadaşlarının ve ailesinin ölümleriyle yüzleşmeli, bazıları hangi değerli şeylerin korunması gerektiğini fark etmeli ve bazıları meydana gelen savaşlarda anlam bulmalıdır. Makoto’nun önünde, gizemli transfer öğrencisi Ryouji Mochizuki belirir. Grup yeni bir sabahı selamladığında kaderin çarkları dönmeye başlar. Her bir kahramanın bağı etrafında dönen bir savaş başlar…