21 yaşındaki Tim Goodman, annesinin ölümünden sonra Pokémon eğitmeni olma hayalinden vazgeçerek babası Harry Goodman’dan ayrı yaşamaya başlamıştır. Bir gün insanların ve Pokémon’ların uyum içinde birlikte yaşadığı bir şehir olan Ryme Şehri polisinden dedektif olan babasının bir trafik kazasında öldüğü haberini alır. Tim, babasının ölümü hakkında bilgi almak için gittiği Ryme Şehrinde, öldü sanılan babasının Pokémon partneri Pikachu ile tanışır. Birbirlerinin ne dediklerini anlayan bu ikili Harry’nin şüpheli ölümünü araştırmaya karar verir.